Фамилия Гаргарина — редкий случай, когда привычный суффикс -ин обманчив. На первый взгляд кажется, что перед нами типичная «матронимическая» фамилия от женского имени Гаргара, но это не так. В русской ономастике фамилии на -ин обычно образуются от основ на -а, -я (Петин, Ильин, Гаргарин), но здесь основа Гаргар- не имеет соответствия в святцах или народных календарях. Вероятнее всего, в основе лежит прозвище Гаргара — так в псковских и новгородских говорах называли горластого, крикливого человека, либо того, кто «гаркает» — громко говорит или понукает лошадей. Глагол «гаркать» (кричать, звать) фиксируется в северо-западных диалектах, и фамилия Гаргарин могла закрепиться за потомками такого обладателя голоса.

Менее распространённая версия связывает фамилию с тюркскими корнями: в некоторых тюркских языках «гаргар» означает «шумный», «беспокойный». Однако для русской фамилии, особенно с суффиксом -ин, диалектное славянское объяснение выглядит естественнее. Географически фамилия Гаргарина встречается редко, но её следы можно найти в старых переписях Псковской губернии — именно там фиксировались прозвища с корнем «гар-». Интересно, что фамилия не имеет отношения к знаменитой фамилии Гагарин: там основа — от слова «гагара» (птица), а здесь — от глагола со значением звука. Так что предки современного носителя фамилии Гаргарина, скорее всего, были людьми с громким голосом, возможно, пастухами или бирючами, чья работа требовала перекрикивать толпу или скот.