Фамилия Гелле — один из тех случаев, когда происхождение почти наверняка не русское, а немецкое или еврейское. В русском языке нет суффиксов, которые образовывали бы фамилию от основы «гел-»: окончание -е в фамилии Гелле — это не русское окончание, а застывшая часть немецкой или идишской фамильной модели. Носители этой фамилии в России, скорее всего, потомки переселенцев из Германии или еврейских семей, живших на территории Российской империи.

Если отталкиваться от немецкого корня, то основой могло стать слово «gelb» (жёлтый) в диалектном произношении. В таком случае фамилия Гелле — это прозвище по цвету волос (блондин) или по профессии красильщика. Вторая, не менее вероятная версия — топонимическая: Гелле (Helle) — это название нескольких населённых пунктов в Германии и Нидерландах. Предок мог получить фамилию по месту, откуда приехал. Третья версия — от древневерхненемецкого «halo» или «hallo» (герой, славный воин), но это более редкая гипотеза, и подтвердить её сложно.

Для еврейского ашкеназского ареала фамилия Гелле часто является вариантом фамилии Геллер, которая в свою очередь восходит к названию города Хелл (Höll) в Силезии или к слову «hell» (светлый, ясный) на идише. В этом контексте фамилия могла быть дана как прозвище человеку со светлыми волосами или светлой кожей, либо как искусственная фамилия, выбранная при обязательной паспортизации евреев в Российской империи в XIX веке.

В русском языке фамилия Гелле остаётся несклоняемой, что типично для заимствованных фамилий на гласный. Встречается она в основном в регионах, где исторически были немецкие колонии (Поволжье, юг Украины, Санкт-Петербургская губерния), а также в городах бывшей черты оседлости. Поскольку фамилия редкая, её география может многое сказать о конкретной ветви рода: если предки были немцами-колонистами, записи стоит искать в лютеранских метрических книгах, если евреями — в раввинских записях и ревизских сказках.

Стоит учесть, что из-за схожести с фамилией Геллер при переписях и переездах могла возникать путаница. Поэтому при поиске корней полезно проверять оба варианта написания, особенно в документах XIX — начала XX века.