Фамилия Гениятова — женская форма от Гениятов, и её разумнее всего разбирать через мужской вариант. В основе лежит имя или прозвище Геният. Это слово — не исконно русское, а, скорее всего, тюркское или арабо-тюркское по происхождению. В нём угадывается корень, родственный арабскому «джаннат» (рай, сад) или «джанна» (райская обитель). В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя Геният (или Гениятулла) встречается как вариант имени Дженнет, что означает «райский», «благодатный». Таким образом, предок носителя фамилии мог быть назван в честь религиозного понятия или с пожеланием райской жизни.

Модель образования простая и типичная для народов Поволжья и Урала: к восточному имени Геният добавили русский патронимический суффикс -ов (Гениятов). Суффикс указывает на принадлежность: «сын Генията». Фамилия закрепилась в среде крещёных татар или башкир, а также среди русских, живших в смешанных с тюрками регионах. Женская форма Гениятова, соответственно, означает «дочь (или жена) Генията» и передаётся по наследству от отца или мужа.

Географически фамилия тяготеет к Оренбургской области, Башкортостану и Татарстану. В этих краях она встречается нечасто, но стабильно — как след давней ономастической традиции. В отличие от более массовых фамилий на -ов от славянских имён, Гениятов — яркий маркер межэтнического культурного обмена: тюркское имя получило русское оформление, и так появилась фамилия, которую сегодня носят люди разной этнической принадлежности.

Есть и другая, менее распространённая версия: Геният могло быть прозвищем от диалектного глагола «генить» (в некоторых говорах — хитрить, изворачиваться). Однако подтверждений этой гипотезе в словарях русских говоров почти нет, а арабско-тюркская этимология выглядит убедительнее — она опирается на реально бытующие у татар и башкир личные имена. Так что основная версия остаётся «райской».