Фамилия Гердюкова — женская форма фамилии Гердюков. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Гердюк, и здесь мы сразу сталкиваемся с неочевидным корнем. Самая вероятная версия связывает его с диалектным словом «герда» или «гердень» — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли настил из жердей, мостки или даже загородку для скота. Человек мог получить прозвище Гердюк по месту жительства у такого моста или по занятию: например, если он строил и чинил эти настилы. Менее распространённая гипотеза выводит основу из тюркских языков, где «гердек» означало «невеста» или «свадебный полог», но для русской фамилии это менее характерно.

Суффикс -юк в фамилии — типичный для западнорусских, украинских и белорусских земель уменьшительный или принадлежный формант. Он указывал на младшего в семье или на сына человека с таким прозвищем: Гердюк — «маленький Герда» или «сын Герды». Окончание -ов добавилось при русификации фамилии, что часто происходило при переписях или переходе носителей в великорусскую среду. Таким образом, Гердюков — это «сын (или потомок) Гердюка».

Географически фамилия Гердюкова встречается в основном в южных регионах России — в Ростовской, Волгоградской областях, а также в Краснодарском крае. Это подтверждает её связь с южнорусскими говорами и возможное украинское происхождение. В отличие от более массовых фамилий на -ов, эта форма сохраняет региональный колорит и указывает на конкретную диалектную среду.

Сословно предки Гердюковых, скорее всего, были крестьянами или казаками. Прозвище, связанное с бытовой постройкой, редко давали знати — оно прикладное, «земляное». Никаких известных дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В архивах можно найти записи о крестьянах и казаках с фамилией Гердюков в станицах Области Войска Донского конца XIX века.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Гердюков стоит в одном ряду с Гердовым, Гердиным и Гирдиным. Все они образованы от схожих диалектных основ, но Гердюков выделяется именно суффиксом -юк, который чётко маркирует южное или украинское происхождение.