Фамилия Герганкин — редкий случай, когда прозвищная основа не бросается в глаза, но при ближайшем рассмотрении раскрывает интересную словообразовательную историю. В центре внимания — суффикс -ин, указывающий на принадлежность: Герганкин — «чей?» — потомок человека по прозвищу или имени Герганка или Герган. Но что стоит за этим корнем?

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркскими или кавказскими корнями. В тюркских языках слово «герган» или «герген» могло означать «пришедший», «прибывший» или даже «странник». В некоторых диалектах «герган» — это название птицы (возможно, вариант «гарган» — утка или селезень). Встречается и вариант, что основа восходит к личному имени Герган — уменьшительной форме от Герасим (греческого происхождения, означает «почтенный»), но тогда логичнее была бы форма Герасимкин или Гераськин. Скорее всего, перед нами некалендарное, мирское прозвище.

Фамилия явно не столичная и не дворянская. Типичная крестьянская или посадская фамилия, которая закрепилась за одним родом, скорее всего, в центральных или южных губерниях России, где было сильное тюркское влияние (например, на территории бывшего Казанского ханства или в Поволжье). Суффикс -ин, а не -ов, указывает, что прозвище оканчивалось на -а или -я: Гергана, Герганка. Исходное прозвище могло звучать как Герганка — прозвище человека, которого дразнили за медлительность («пришлый», «заезжий») или за сходство с птицей.

Встречаются варианты написания: Герганкин и, возможно, искажённое Гирганкин — из-за «акающего» произношения. Фамилия настолько редкая, что её носители, скорее всего, восходят к одному общему предку, получившему прозвище несколько столетий назад. В современных справочниках фамилия почти не фиксируется, что делает её ценной для генеалогического поиска: чем реже фамилия, тем проще восстановить родословную по документам XVIII–XIX веков в конкретном уезде.