Фамилия Гергишанов — редкая и с трудом поддающаяся однозначной этимологии. На первый взгляд она кажется «восточной», но при детальном разборе выясняется, что её корни, скорее всего, лежат в славянской ономастике, осложнённой необычным суффиксом.

Ключ к пониманию — формант -анов. В русских фамилиях он встречается реже, чем стандартные -ов/-ев, и обычно указывает на притяжательное значение от основы, оканчивающейся на -а или -я (ср. Баранов, Толканов). В случае с Гергишановым основа — Гергишан. Это имя или прозвище, скорее всего, образовано от церковного имени Георгий (в просторечии Егорий, Егор). В южнославянских и некоторых западнорусских говорах имя Георгий могло звучать как Гергий или Герго. Уменьшительная форма от него — Гергиш (с суффиксом -иш, как Пётр — Петриш). Далее к этому прозвищу добавили ещё один уменьшительный суффикс -ан, получив Гергишан — «маленький Гергиш» или «сын Гергиша».

Таким образом, Гергишанов означает «потомок Гергишана», а сам Гергишан — это двойное уменьшительное от Георгия. Фамилия могла возникнуть в среде, где была распространена «окающая» или «гэкающая» речь (характерно для рязанских, тульских, а также белорусских и украинских говоров), где начальное «г» произносится твёрдо.

Альтернативная, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В языках народов Кавказа и Поволжья встречается имя Гергиш (от того же Георгия, но через тюркское посредство). Однако суффикс -анов в этом случае выглядит искусственным — в тюркских фамилиях чаще встречаются -ов/-ев, прикреплённые прямо к основе (Гергишов). Форма «Гергишанов» выдает именно русскую словообразовательную модель с нанизыванием суффиксов, что типично для прозвищ, а не для прямого заимствования.

Географически фамилия тяготеет к югу России, возможно, к казачьим регионам или к территориям, где смешивались славянские и тюркские народы. Носители фамилии, вероятно, были крестьянами или однодворцами, получившими прозвище по имени отца или деда.

В дореволюционных метрических книгах фамилия почти не встречается, что подтверждает её позднее оформление и низкое распространение. Сегодня она остаётся одной из тех редких фамилий, которые хранят в себе сразу несколько языковых слоёв: церковное имя, народную диалектную форму и сложную модель русского прозвища.