Фамилия Гибатуллина — женская форма фамилии Гибатуллин, которая имеет ярко выраженное тюркское происхождение, а точнее — восходит к арабо-мусульманской ономастике, распространённой у татар и башкир. Основа фамилии — мужское имя Гибатулла, что в переводе с арабского означает «дар Аллаха» или «подарок Всевышнего» (от слов «гиба» — дар и «Аллах» — Бог). Суффикс -ин указывает на принадлежность: в русской модели фамилий он значит «чей?», то есть «сын Гибатуллы». В татарской среде фамилии на -ин и -ов часто калькировали русскую форму при оформлении документов в XIX — начале XX века, поэтому Гибатуллин — это не русификация, а адаптация через патронимический суффикс.

Интересно, что имя Гибатулла не было редким в среде волго-уральских татар и башкир. Оно относится к теофорным именам (содержащим имя Бога), и его носили люди, чьи родители подчёркивали религиозность или благодарность за рождение ребёнка. Фамилия могла возникнуть в любой местности, где жили татары или башкиры — от Казани до Оренбуржья, но чаще всего её носители встречаются в Татарстане, Башкортостане и в Челябинской области. Из-за того что фамилия образована от полного арабского имени, а не от прозвища, её этимология прозрачна и не вызывает споров — в отличие от многих фамилий, где корень затемнён.

В русском языке ударение в фамилии Гибатуллина обычно падает на третий слог: Гибату́ллина, хотя в татарском произношении ударение может смещаться на последний слог. Встречаются варианты написания через «ы» — Гыйбатуллина, что отражает татарскую фонетику (твердое «г»), но в паспортах и документах закрепилась форма через «и». Фамилия не имеет отношения к дворянству или сословным привилегиям — её носители в основном были крестьянами и мещанами, а позже — рабочими и интеллигенцией в советское время. Родственные фамилии: Гибадуллин, Гибатов, Габдуллин — все они образованы от арабских имён с корнем «гиба» или «габд» (раб Божий), но Гибатуллин стоит особняком из-за прямого указания на «дар», а не на «служение».