Фамилия Гибайдуллина — женская форма мужской фамилии Гибайдуллин, и чтобы понять её корни, нужно разобраться с мужским вариантом. Это типичная тюркская фамилия, образованная по арабо-персидской модели: она восходит к личному имени Гибайдулла. Имя это составное: «гибад» (слуга, раб) + «улла» (Аллах). В буквальном переводе — «слуга Аллаха». Такие имена с компонентом «слуга/раб Бога» широко распространены в исламской культуре (ср. Убайдулла, Абдулла).

Морфологически фамилия строится по стандартному для тюркских языков патронимическому принципу: к имени добавляется русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность. То есть Гибайдуллин — «сын Гибайдуллы», а Гибайдуллина — «дочь» или «жена» того же рода. Суффикс -ин в русском языке традиционно присоединяется к основам на -а, -я, что и произошло: Гибайдулла → Гибайдуллин.

Географически фамилия плотнее всего привязана к Волго-Уральскому региону: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. В этих местах имя Гибайдулла было особенно распространено среди татар и башкир, а после перехода к фамильной системе (в XIX–XX веках) закрепилось как наследственное. Есть и редкий вариант написания — Гибайдуллина с одной «л» (Гибайдулина), но он встречается реже и чаще всего является следствием ошибки в документах.

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий на -ин, где основа могла быть прозвищем или названием профессии, здесь перед нами чистое религиозное имя. Носители фамилии Гибайдуллина в подавляющем большинстве — потомки людей, чей предок носил имя, подчеркивающее благочестие. Это не ремесленная, не географическая, а именно именная фамилия, что сразу отличает её от, скажем, Кузнецовых или Заречных.

О социальном статусе первых носителей сказать сложно: имя Гибайдулла могли дать в любой среде, от крестьян до мулл. Но сам факт, что фамилия сохранилась и широко бытует сегодня, говорит о прочной укоренённости в тюрко-мусульманской среде России.