Фамилия Гинкас — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение напрямую связано не со славянскими корнями, а с литовским языком. Основа фамилии — личное имя Гинкас, которое представляет собой производную форму от таких имён, как Гинтарас (янтарь) или Гинвидас. В литовской традиции суффикс -кас часто образует уменьшительно-ласкательные или обиходные варианты имён, поэтому Гинкас могло означать «маленький Гинтарас» или просто «Гинька».

Географически фамилия тяготеет к западу бывшей Российской империи. Носители фамилии Гинкас — это, скорее всего, потомки литовцев или белорусов, живших на территории Литвы, Сувалкской или Ковенской губерний. В XIX веке, когда многие литовцы переезжали в города или переселялись вглубь России, фамилия могла закрепиться в документах именно в такой форме — без русификации, с сохранением литовского окончания -ас.

Словообразовательная модель здесь проста: корень Гинк- и типичный литовский суффикс -ас, указывающий на мужской род. В русском языке такая фамилия не склоняется по падежам как типичная славянская, а остаётся неизменной: «у Гинкаса», «с Гинкасом». Это сразу выдает её иноязычное происхождение.

Есть версия, что Гинкас могло быть прозвищем, образованным от литовского глагола ginti — «защищать, оборонять». В таком случае предок мог получить фамилию за воинский или сторожевой характер службы. Однако это менее надёжная гипотеза, так как суффикс -кас в прозвищах встречается реже, чем в личных именах.

Сословная принадлежность носителей фамилии Гинкас, скорее всего, была крестьянской или мещанской. В дворянских родословных книгах Российской империи эта фамилия не фиксируется, что подтверждает её «простое» происхождение. Сегодня фамилия остаётся малораспространённой, но благодаря известному режиссёру Каме Гинкасу она приобрела узнаваемость в культурной среде.