Фамилия Гинкин образована по распространённой славянской модели с суффиксом -ин. В русской ономастике суффикс -ин (а также варианты -ын, -их, -ых) указывает на принадлежность: «чей?» — «Гинкин» значит «сын Гинки» или «человек из рода Гинки». Такие именования широко представлены у восточных, западных и южных славян, хотя сам суффикс особенно характерен для русского и белорусского ареала.

Основа фамилии — Гинка. Это могло быть личное имя, прозвище или уменьшительная форма от христианского имени. Самое вероятное объяснение: Гинка — народная форма имени Евгений (через Гиня, Гинька). В диалектах и бытовой речи «Гинка» или «Гинька» встречаются как ласкательные варианты от Евгений, а также реже от Геннадий. Вторая версия, менее распространённая, связывает Гинку с еврейским именем Гирш или Гинда, но для русской фамилии это спорно: суффикс -ин в чисто еврейских фамилиях редок, а модель «имя + -ин» типична для славянского крестьянского именослова.

Таким образом, предок носителя фамилии Гинкин, скорее всего, звался Гинкой — либо по домашнему имени, либо по прозвищу, которое закрепилось за ним в общине. Фамилия не указывает на сословие или род занятий: она образована от личного имени, а не от профессии или места жительства. Встречается она в основном в центральных и северных регионах России, что типично для фамилий на -ин, но точная география бытования без специальных подсчётов неочевидна. Известных носителей, оставивших заметный след в истории, среди Гинкиных нет — это рядовая, но по-своему характерная фамилия, сохранившая в основе живую народную форму имени.