Фамилия Гинькин — редкий случай, когда короткая основа сразу указывает на географический и этнический источник. Вопреки интуитивному желанию искать корень в русском «гинь» (такого слова нет), фамилия почти наверняка восходит к белорусскому или украинскому прозвищу Гинька. В основе лежит диалектное «гiнькать» — так в западных говорах называли человека, который говорит невнятно, гнусаво или картаво, то есть «гiнькает». Это звукоподражательное прозвище, по той же модели, что и «Цокин» (от цокающего говора) или «Шепелин».

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Гинькин — сын Гиньки. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я, но сама основа Гинька — характерный признак белорусского ономастикона. В России фамилия встречается крайне редко и концентрируется в западных областях — Смоленской, Брянской, Псковской, то есть на границе с Беларусью. Это косвенно подтверждает западнорусское или белорусское происхождение первого носителя.

Версия о связи с еврейской фамилией Гинькин (от идишского «гинк» — хромой) возможна, но менее вероятна для русского написания. В еврейском варианте фамилия обычно фиксируется как Гинкин или Гинкель, а форма с мягким знаком и суффиксом -ин — типично славянская. Если бы фамилия была еврейской по происхождению, в документах XIX века она чаще писалась бы через «и»: Гинкин.

Таким образом, предок носителя фамилии Гинькин был, скорее всего, крестьянином или мещанином из западных губерний Российской империи, которого прозвали за особенность речи. Фамилия не дворянская и не купеческая — по сословному составу она относится к среде, где прозвища давали по характерной примете, а не по профессии или имени отца.