Фамилия Гинькинева — редкая и неочевидная по происхождению. Начинать её разбор стоит не с корня, а с суффикса, который сразу выдаёт модель образования. Окончание -ев (а не -ов) указывает на то, что основа фамилии оканчивалась на мягкий или шипящий согласный. В мужском варианте это Гинькинев, женский — Гинькинева. Суффикс -ин- в середине слова (Гинь-кин-ев) на первый взгляд похож на притяжательный формант, но здесь он, скорее всего, часть сложной основы, а не отдельный суффикс фамилии.

Самая вероятная версия: основа «Гиньк-» восходит к прозвищу или имени, образованному от слова «гинька». В русских говорах, особенно в южнорусских и украинских, «гинька» — это уменьшительно-пренебрежительное от «Гиня» (производное от имени Геннадий или Евгений). Геннадий в народе часто сокращали до Гена, а оттуда — до Гиня; Евгений давал форму Геня, которая тоже могла перейти в Гиня. Тогда Гинька — это человек, которого в быту звали Гинькой (как Ванька, Петька). Фамилия Гинькинев буквально означает «потомок Гиньки», то есть сын или внук того, кого звали Гинькой.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «гинь» или «гиня», которое в некоторых регионах означало «вялый, хилый человек» или «недотёпа». В этом случае прозвище Гинька дали бы нерасторопному или слабому человеку. Однако эта гипотеза слабее, потому что слово «гинь» в таком значении крайне локально и почти не зафиксировано в письменных источниках, а имя-основа Гинька встречается в актах XVII–XVIII веков, что делает первую версию более надёжной.

Географически фамилия Гинькинева тяготеет к регионам, где были распространены фамилии на -ев с мягкой основой: юг России, Поволжье, а также территории, граничащие с Украиной. Встречаемость её крайне низкая, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного конкретного рода, который дал начало нескольким ветвям. Сословно носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, поскольку фамилия образована от просторечной формы имени, а не от церковного канона.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Гинькин, Гиньков, Гинькевич) показывает, что Гинькинев — более редкий вариант, где суффикс -ев присоединён к основе, уже содержащей -ин. Такая двойная суффиксация (корень + -ин- + -ев) встречается в фамилиях, образованных от прозвищ с уменьшительным суффиксом -к- (Гинька → Гинькин → Гинькинев), что типично для поздних фамилий, когда к уже существующей фамилии на -ин добавляли патронимический суффикс.