Фамилия Гинятуллин происходит от арабского мужского имени Гинятулла. Это имя составное: его первая часть, Гинаят, означает «проявление милосердия» или «оказание помощи», а вторая, Улла, восходит к слову Аллах (Бог). Вместе имя переводится как «милосердие Аллаха» или «помощь Бога». Такие теофорные имена, включающие имя Всевышнего, широко распространены в мусульманской традиции.

Фамилия образована по русской словообразовательной модели: к основе имени Гинятулла добавили патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность («сын Гинятуллы»). Подобный способ оформления фамилий типичен для татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья, исповедующих ислам, — они заимствовали русскую модель фамилий, сохранив арабские корни личных имён.

Встречаются варианты написания: Гиниятуллин, Гинетуллин. Разница в огласовке связана с особенностями произношения в разных диалектах татарского и башкирского языков. В документах XIX — начала XX века, когда фамилии активно фиксировались, писарь мог записать имя на слух, что закрепило разные формы в одной семье.

Географически фамилия Гинятуллин чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. Это говорит о том, что предки носителей фамилии были выходцами из волго-уральского региона, где ислам имеет глубокие исторические корни.

Родственные фамилии — Гиниятуллин, Гинятулов, Гинетов — образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Все они указывают на общее имя-основу, связанное с религиозным понятием божественной помощи.