Фамилия Гиркина образована от прозвища Гирка. В южных губерниях Российской империи «гиркой» называли особый сорт яровой пшеницы — мягкой, без плёнки, которую охотно покупали за границу. Прозвище мог получить крестьянин, который растил именно эту пшеницу и, возможно, торговал ею. Фамилия закрепилась по типичной русской модели: основа Гирк- плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Гирки).

Существует и другая версия, но она менее убедительна. Согласно ей, Гиркина — фамилия еврейского происхождения, восходящая к имени Гирке, краткой форме немецкого Герхардт. В этом случае корни уходят в древнегерманские слова со значением «копьё» и «сильный, смелый». Однако для русской ономастики естественнее объяснение через местное южное слово «гирка»: оно прямое, бытовое и не требует привлечения заимствованных имён. Фамилия Гиркина — типичный пример того, как прозвище, данное по роду занятий или хозяйственной примете, стало родовым именем.