Фамилия Глинной — один из редких примеров, где окончание -ой не на служебном суффиксе (как в Толстой или Кривой), а часть корня. На письме её легко спутать с фамилией Глинный, но разница принципиальна: в фамилии Глинной ударение почти наверняка на первый слог — Гли́нной. Сама фамилия образована по модели притяжательного прилагательного с суффиксом -ин-: от слова «глина» через промежуточную форму «Глинна» (женское имя или прозвище) либо напрямую от прозвища Глинной, которое означало «сделанный из глины» или «живущий на глинистой почве».

Исходная основа проста — «глина». В русских говорах «глиной» могли называть не только материал, но и человека с землистым цветом лица, а также того, кто работал с глиной: гончара, кирпичника, землекопа на глинище. Однако фамилия Глинной не обязательно указывает на ремесло. Чаще всего на Руси такие прозвища давали по месту жительства: если деревня стояла на глинистом берегу или на глиноземе, жителя звали Глинной — «тот, кто с глинища». Фамилия закрепилась в северных и центральных губерниях, где глина была основой для промыслов, но встречается и на юге, в чернозёмных областях, где «глина» — контраст плодородной почве.

С точки зрения словообразования фамилия уникальна тем, что сохранила архаичную форму прилагательного с окончанием -ой в именительном падеже, характерную для древнерусских прозвищ (ср. Земляной, Деревяной). В XIX веке такие фамилии часто «обрубали» до коротких форм (Глинный, Глинин), но вариант Глинной удержался в тех родах, где прозвище было записано в документах как полное прилагательное. Если искать однокоренные фамилии — Глинин, Глинов, Глинский — то Глинной стоит особняком: это не патроним и не топоним с суффиксом -ск-, а прямое прозвище, которое почти не изменилось за столетия.

Встречается фамилия редко, что объяснимо: в переписях её часто «исправляли» на более привычную Глинный или Глинин. Носители фамилии Глинной — это, скорее всего, потомки крестьян или ремесленников из одного локального гнезда, где прозвище прижилось именно в такой форме.