Фамилия Глубошев — редкий случай в русской ономастике, где основа, скорее всего, не связана с прилагательным «глубокий» или существительным «глубина». Прямое значение «глубокий» (например, глубокий овраг или колодец) могло бы дать фамилию Глубоков или Глубинин, но не Глубошев. Здесь работает другой механизм словообразования: суффикс -ош- в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на прозвище, образованное от глагола или имени.

Самая правдоподобная версия — происхождение от прозвища Глубош. В основе лежит глагол «глубить» (устаревшее — делать углубление, долбить, рыть). Глубошем могли называть человека, который занимался углублением колодцев, рытьём канав, земляными работами, или же мастера по выдалбливанию корыт, лодок-долблёнок. В говорах встречается слово «глубить» именно в значении «долбить, выдалбливать», что делает это прозвище профессиональным. Суффикс -ош- в русских прозвищах (сравните: Кривош — от кривой, Ломонос — от ломать нос) придаёт слову оттенок действия или характерного признака. Таким образом, Глубош — это «тот, кто глубит», мастер по долблению.

Менее вероятна, но допустима связь с диалектным словом «глубошь» (глушь, чаща, глухое место). В этом случае прозвище давали человеку, жившему в глухом лесу или отдалённой местности. Однако слово «глубошь» в значении «глушь» фиксируется редко и в основном в северных говорах, поэтому версия с ремеслом выглядит надёжнее.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: прозвище Глубош + притяжательный суффикс -ев (в безударной позиции после шипящего пишется -ев, а не -ов). «Глубошев» буквально означает «сын Глубоша». Встречаемость фамилии крайне низкая. По данным открытых источников, основная масса носителей сосредоточена в центральных и южных областях России (Воронежская, Ростовская области), что косвенно подтверждает бытовой, ремесленный характер прозвища — в чернозёмных регионах было развито рытьё колодцев и земляные работы.

Однокоренных фамилий, построенных по той же модели, практически нет. Встречается фамилия Глубош (без суффикса), но она ещё реже. Фамилия Глубошев — не дворянская, не семинарская (искусственная), а чисто народная, прозвищная. Она не связана с географическими названиями (нет известного села Глубоши), что окончательно склоняет чашу весов в пользу версии о прозвище по занятию или характерному действию.