Гнатыша – это народная форма канонического мужского имени Игнатий. Оно имеет латинское происхождение и означает «огненный». Среди святых покровителей этого имени — Игнатий, патриарх Константинопольский и священномученик Игнатий Богоносец, ученик Иоанна Богослова, который был первым крупным христианским писателем не еврейского происхождения. Скорее всего, основатель рода Гнатышиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Гнатыша, со временем получил фамилию Гнатышина.