Фамилия Гнатышин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Гнатышин послужило церковное имя Игнатий. Гнатыша – это народная форма канонического мужского имени Игнатий. Оно имеет латинское происхождение и означает «огненный». Среди святых покровителей этого имени — Игнатий, патриарх Константинопольский и священномученик Игнатий Богоносец, ученик Иоанна Богослова, который был первым крупным христианским писателем не еврейского происхождения. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Гнатыша, со временем получил фамилию Гнатышин. О точном месте и времени возникновения фамилии Гнатышин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Гнатышин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.