Фамилия Гнатышын звучит непривычно для русского уха, но для украинского и польского слуха в ней нет ничего странного. Это яркий пример фамилии, образованной по западнославянской и украинской модели. В основе лежит имя Гнат — народная форма канонического имени Игнатий (от латинского ignis — «огонь»). Суффикс -ыш- указывает на принадлежность или происхождение: в украинском и польском языках такие суффиксы часто добавляли к именам, чтобы образовать фамилию, отвечающую на вопрос «чей?». Финальное -ын — это адаптированное к восточнославянской письменности окончание, которое в оригинале могло звучать как -ин или даже -ич.

Если разложить фамилию на части, получится: Гнат + ыш + ын. Буквально это означает «сын Гнатыша», где Гнатыш — уменьшительно-ласкательная или патронимическая форма от Гнат. То есть предок носителя фамилии не был просто Гнатом, его звали Гнатыш — возможно, так в семье называли младшего сына или подростка. Подобная модель (имя + -ыш + -ин) встречается в украинских фамилиях довольно часто, но в русском языке она редка, что сразу выдает региональное происхождение.

Географически фамилия Гнатышын с наибольшей вероятностью закрепилась на западе Украины — в Галичине, на Волыни или в Подолье. В этих краях суффикс -ыш в фамилиях встречается куда чаще, чем в центральных или восточных областях. В польском языке тоже есть фамилии с похожей структурой, например, Gnatyszyn, что подтверждает тесное переплетение культур на границе Украины и Польши. Русская орфография сохранила написание через Ы, что для украинского языка нехарактерно (там было бы «Гнатишин»), но в российских документах XIX—XX веков фамилию могли записать на слух, с «ы» вместо «и».

Крестьянское происхождение фамилии почти не вызывает сомнений: в дворянской среде такие «простые» патронимы не приживались, а вот среди сельского населения Украины и Польши они были нормой. Предок Гнатышын, скорее всего, был крестьянином или мещанином, которого в официальных бумагах записали по отцу — Гнатышу. Никакого отношения к ремеслу или прозвищу фамилия не имеет, она чисто «именная», что делает её историю прозрачной: имя Игнатий, пройдя через народное сокращение и местные суффиксы, превратилось в фамилию, которая до сих пор звучит как указание на родство.