Фамилия Гнедиков отталкивается от прозвища Гнедик, а то, в свою очередь, — от прилагательного «гнедой». Владимир Даль в своём словаре объясняет «гнедой» как масть лошади (и некоторых других животных): тёмно-рыжая шерсть с чёрным хвостом и гривой. Эта прямая связь с конским окрасом — самая надёжная версия происхождения фамилии.

Прозвище Гнедик могли дать по двум основным сценариям. Первый — ремесленный: человек разводил или держал лошадей именно гнедой масти, возможно, был конюхом или барышником, специализировавшимся на этой породе. Второй — внешний: сам обладатель прозвища мог быть рыжеватым, с тёмными волосами и бровями, что напоминало ту самую масть. Слово «гнедой» в переносном смысле к людям применяли редко, но для меткого деревенского прозвища такой ход вполне естественен.

Суффикс -ик в основе Гнедик указывает на уменьшительную или обиходную форму прозвища. То есть человек был не просто «Гнедой», а «Гнедик» — возможно, младший в семье или просто носитель чуть смягчённого уличного имени. Фамилии на -ов, образованные от таких прозвищ, типичны для центральной России и северных областей.

Фамилия Гнедиков — довольно редкая, но не уникальная. У неё есть очевидные «родственники»: Гнедов, Гнедой, Гнедко. Все они восходят к тому же корню, но различаются по способу образования. Гнедиков стоит в ряду фамилий, где прозвище получило ласкательный суффикс, что отличает её от более прямолинейной фамилии Гнедов.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные модели описываются как типичные для «конских» прозвищ, перешедших в фамилии. Однако точных статистических данных по распространению именно Гнедиковых нет — фамилия не входит в число массовых, что говорит о её локальном бытовании, скорее всего, в нескольких сёлах или уездах.

Таким образом, предок носителя фамилии Гнедиков с высокой вероятностью был либо конным человеком, либо имел приметную внешность — рыжеватую масть волос. Потомок этого Гнедика и закрепил прозвище в фамильном имени.