Фамилия Гнедиковы (в мужском роде — Гнедиков) образована по стандартной для русских фамилий модели: от прозвища с помощью патронимического суффикса -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Гнедика). Прозвище Гнедик не было редким в среде, где лошадь играла ключевую роль в хозяйстве. В его основе лежит прилагательное «гнедой» — масть лошади, которую В. И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» описывает как «темнорыжую шерсть с черным хвостом и гривой».

Прямая версия происхождения прозвища — профессиональная. Гнедиком могли прозвать конюха или конезаводчика, который занимался разведением и содержанием лошадей именно этой масти. В крестьянском и казачьем быту масть была важнейшей приметой: назвать человека по масти его лошади — обычная практика, порой заменявшая имя. Однако есть и вторая, антропологическая версия. Прилагательное «гнедой» иногда переносили на внешность человека — так могли назвать рыжеватого или темноволосого с рыжиной, то есть обладателя волос цвета гнедой масти. В говорах слово «гнедко» закрепилось и как ласкательное название самой лошади, что делает прозвище ещё более естественным для деревенского обихода.

Суффикс -ик в прозвище Гнедик — уменьшительно-ласкательный. Он не несёт пренебрежения, а скорее указывает на привычное, бытовое именование в кругу семьи или общины. Такие формы были типичны для северных и центральных губерний России. Фамилия Гнедиков встречается в основном в русской среде, хотя однокоренные фамилии (Гнедков, Гнедов, Гнедой) распространены шире. Интересно, что двойное написание «Гнедиковы» во множественном числе подчёркивает родовую принадлежность — так обычно фиксировали фамилию в переписях, имея в виду целую семью или династию.

Примечательно, что эта фамилия не имеет отношения к древнегреческому поэту Гомеру, хотя фамилия его известного переводчика — Гнедич — звучит схоже. Гнедич образована от другого корня (украинского «гнід» — «гнедой»), но с другим суффиксом. Гнедиковы же — пример чисто русской модели именования по внешнему признаку или занятию, уходящей корнями в конюшенный быт допетровской Руси.