Фамилия Гнедочкин образована от прозвища Гнедочка. Оно ведет свое начало от прилагательного «гнедой», значение которого В.И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет следующим образом: «о лошади и некоторых других животных: темнорыжей шерсти или масти, с черным хвостом и гривой». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Гнедочка получил человек, занимавшийся разведением гнедых лошадей. Возможно также, что Гнедочкой прозвали обладателя рыжих волос. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Гнедочка, со временем получил фамилию Гнедочкин.