Фамилия Гнусов образована от прозвища Гнус. По одной из версий, оно ведет свое начало от глагола «гнусить» - «говорить в нос». Вероятно, прозвище Гнус содержало указание на особенности речи основателя фамилии. Согласно другой гипотезе, данное прозвище восходит к нарицательному «гнус» - «мелкие мошки, мошкара, бич для человека и животных в лесах и болотах Севера России и Сибири». Исходя из этого, можно предположить, что Гнусом прозвали либо жителя северных территорий, либо неотступного, настойчивого (как мошкара) человека. Веселовского записаны родственные именования: князь Иван Иванович Гнус Долгорукий (середина XVI в.), а также князь Иван Федорович Гнуса Ромодановский (первая половина XVI в.). Так и прозвище Гнус закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Гнусов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Гнус, со временем получил фамилию Гнусов.