Фамилия Гнусина — женская форма фамилии Гнусин, а та, в свою очередь, образована от личного прозвища Гнуся. Самая прямая версия связывает это прозвище с глаголом «гнусавить», то есть говорить в нос, с неприятным призвуком. Прозвище могли дать человеку с такой особенностью речи, и со временем оно закрепилось как семейное имя.

Есть и вторая версия, менее очевидная, но не менее интересная. Она уводит нас в польский язык, где слово gnus означает «лентяй», а gnusny — «ленивый, подлый». Если принять эту гипотезу, прозвище Гнуся указывало не на манеру говорить, а на характер — ленивый или недобросовестный человек. Однако стоит учесть, что для центральных русских земель, где фамилия Гнусина встречается чаще, эта версия менее вероятна: русская диалектная среда даёт больше примеров прозвищ по физическим признакам (гнусавость), чем по заимствованной польской лексике.

Модель образования простая: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — «сын Гнуси». Это типичный патроним (отчество, ставшее фамилией), характерный для северных и центральных областей России. Любопытно, что в истории известны носители прозвища Гнус и Гнуса среди знати: Иван Иванович Гнус Долгорукий (середина XVI века) и князь Иван Федорович Гнуса Ромодановский (первая половина XVI века). Это показывает, что прозвище бытовало не только в крестьянской среде, но и среди служилых людей, хотя сама фамилия Гнусина впоследствии закрепилась скорее в простонародье.

Таким образом, предок современных носителей фамилии Гнусина, скорее всего, получил прозвище за гнусавый голос, и это прозвище перешло к детям как фамилия. Второй вариант — происхождение от польского «лентяй» — возможен, но остаётся на положении гипотезы без надёжных доказательств.