Фамилия Годес, скорее всего, восходит к женскому еврейскому имени Гадасса. На иврите это слово означает «мирт» — вечнозелёное растение, которое в иудейской традиции символизирует мир и справедливость. Имя Гадасса известно благодаря библейской царице Эсфири, которую в книге Эсфирь также называют Адасса (производная форма от Гадассы). От этого имени через уменьшительные формы (вроде Годе или Годка) и возникла фамилия Годес.

Есть и другая версия, хотя она менее распространена. Согласно ей, Годес — это еврейская адаптация мужского имени Ходор или Тодор, которое у западных и южных славян соответствует русскому Феодору. Феодор, в свою очередь, происходит от греческого Теодорос, что значит «посланник бога» или «божий дар». В этом случае фамилию могли получить потомки человека, которого в обиходе звали Тодор, а в документах записали как Годес — из-за особенностей произношения в разных диалектах идиша.

Первая гипотеза выглядит убедительнее: она объясняет и женскую основу фамилии, и её географию. Фамилия Годес встречается у евреев Восточной Европы — в Польше, на Украине, в Беларуси. В Российской империи её носители жили в черте оседлости, часто в местечках Волынской и Подольской губерний. Суффикс -ес в фамилии типичен для идиша: он образует фамилии от личных имён (ср. Берес, Вольфес, Гиршес) и указывает на принадлежность — буквально «сын Годы» (Года — разговорная форма от Гадассы). То есть предком носителя фамилии Годес могла быть женщина по имени Года, а сама фамилия — отчество по матери.

Написание фамилии устойчивое: через «о» в первом слоге и с «с» на конце. В дореволюционных метрических книгах встречаются варианты Годесъ и Годэс, но они редки. Ударение обычно падает на первый слог — Го́дес.