Фамилия Годяева образована от личного прозвища Годяй. Его происхождение напрямую связано с древнерусским глаголом «годить» — ждать, медлить, выжидать. В этом значении прозвище мог получить человек неторопливый, терпеливый, тот, кого постоянно окликали: «Погоди!». Однако более убедительной выглядит версия, отталкивающаяся от другого смысла того же корня. Слово «год» в древности означало не только временной промежуток, но и нечто «прилаженное, желанное, подходящее». В украинском языке до сих пор бытует слово «годящий» — приятный, угодливый, а в польском «gody» переводится как «пир» или «праздник». Следовательно, прозвище Годяй могли дать долгожданному ребёнку, который «пришёлся ко двору», или младенцу, родившемуся в канун большого торжества.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом принадлежности -ев (в основе на -й). Она указывает на потомка человека по прозвищу Годяй. Написание через «я» в окончании — типичная форма женского рода или родительного падежа (в документах: «Годяева»). В мужском варианте фамилия звучит как Годяев.

Среди известных носителей — протоиерей Алексей Гавриилович Годяев (1900–1991), служивший в русском зарубежье. Его биография подтверждает, что фамилия бытовала в среде духовенства, хотя в целом её носители могли происходить из самых разных сословий: от крестьян до купцов, в зависимости от региона. География распространения фамилии не ограничена одной областью, но чаще встречается в центральных и южных губерниях России.

В отличие от многих фамилий на -ев, у Годяева нет однозначной связи с каноническим именем или названием профессии. Это редкий случай, когда прозвище уходит корнями сразу в две смысловые плоскости: время (ожидание) и качество (пригодность, угодность).