Фамилия Голотина образована от прозвища Голота. В его основе лежит украинское слово «голота», что значит «беднота, неимущие люди». Прозвище Голота давали человеку небогатому, возможно, одинокому или не имевшему своего хозяйства. По этой модели возникли и другие фамилии — Голотюк, Голотенко.

Версия о том, что фамилия произошла от названия небольшого двухмачтового судна голет, менее правдоподобна. Слово «голет» — заимствованное, морского происхождения, и в народной среде, где складывались прозвища, оно было редким. Если бы предок носителя фамилии был судостроителем или служил на таком судне, скорее всего, его прозвали бы Голетчик или Голетов, а не Голота.

Суффикс -ин в фамилии Голотина указывает на принадлежность: «чей?» — сын Голоты. Такая модель типична для центральных и северных регионов России. Фамилия встречается там же, где исторически было распространено украинское население или где прозвище Голота могло закрепиться в русской среде. В написании с одной «т» фамилия сохранила исходный вид прозвища, без наращения, которое иногда возникает в фамилиях на -ин.