Фамилия Головченков — одна из тех, что хранит память о прозвище предка. В её основе лежит слово «голова», но не в прямом, а в переносном, социальном смысле. Прозвище Головко на Руси давали не просто человеку с крупной головой, а тому, кто стоял во главе общины — сельскому старосте, которого нередко называли «головой». Так что первым носителем прозвища мог быть уважаемый человек, занимавший руководящую должность в своей округе.

Словообразовательная модель фамилии складывается из трёх звеньев. Сначала было прозвище Головко, от него образовали отчество первой ступени — Головченко (суффикс -енко типичен для украинской ономастики и означает «маленький» или «сын»). Затем от этого отчества возникла уже русская по форме фамилия Головченков с суффиксом -ов, который добавлялся к фамилиям на -енко при адаптации в великорусской среде. Получается, что Головченков — это отчество второго порядка: сын Головченко, внук Головка.

Такая двойная суффиксация — редкая деталь. Она говорит о том, что предки носителей фамилии, скорее всего, переселились с украинских земель на русские, где их родовое имя «переоформили» по местным стандартам. Фамилия не привязана к какому-то одному региону: её можно встретить и в южнорусских областях, и в центральной России, что подтверждает миграционный след.

О точной дате появления фамилии судить трудно: процесс шёл несколько столетий, а письменные источники фиксируют такие фамилии в основном с XVII–XVIII веков. Но ясно одно: Головченковы — потомки человека, которого в своём селе называли Головко, и это прозвище говорило о его положении, а не о внешности.