Фамилия Гонен — редкий случай в русской ономастике, и её разбор сразу ставит вопрос: перед нами исконно славянская фамилия или заимствованная? Всё зависит от того, где искать корни.

Если считать фамилию восточнославянской, то в её основе лежит прозвище Гоня или Гон. В русских говорах «гон» — это не только быстрое движение, но и пастбище, выгон для скота, а также расстояние, которое можно проехать или пройти без отдыха. Прозвище Гоня могли дать человеку, который пас скотину на общинном выгоне, или, наоборот, быстрому, торопливому парню. Суффикс -ен в фамилии — нестандартный для классической русской модели. Обычно русские фамилии образуются с помощью -ов/-ев, -ин, -ский. Форма на -ен (Гонен) скорее характерна для украинской или белорусской традиции, где встречаются фамилии вроде Гоненко, Гоненок, а усечённый вариант Гонен мог возникнуть при русификации или записи в документах. В этом случае фамилия означает «сын Гони» или «потомок того, кого звали Гоня».

Вторая версия — фамилия могла прийти из идиша. В еврейской традиции Гонен (или Гонен) — это вариант фамилии, образованной от слова «гонен» (гонимый, преследуемый) или от имени Гена (Геннадий) в ашкеназской передаче. Такие фамилии часто давали в черте оседлости в XIX веке, и они фиксировались по звучанию, без строгой привязки к профессии. Географически фамилия Гонен встречается в западных регионах бывшей Российской империи — на Украине, в Беларуси, а также среди еврейских общин, что подтверждает обе версии.

Спор между славянским и еврейским происхождением решается просто: если в семье сохранились предания о том, что предки были крестьянами-скотоводами из Черниговской или Волынской губернии, версия с прозвищем Гоня правдоподобнее. Если же фамилия встречается в сочетании с типично еврейскими именами или родственными фамилиями (Гоненштейн, Гоненберг), то корни — в идише. Без дополнительных данных оба варианта равноправны.

Что точно можно сказать: фамилия Гонен — короткая, звонкая и нечастая. В дореволюционных списках она не попала в число массовых, а значит, её носители, скорее всего, происходят из одной или нескольких семей, разошедшихся по разным уголкам империи. Сегодня она может быть как русской, так и еврейской — и это не делает её менее интересной для изучения, а наоборот, заставляет искать конкретные документы.