Фамилия Горефанова — вариант женского рода, мужская форма — Горефанов. Это редкая фамилия, которая сразу привлекает внимание необычным звучанием. Вопреки первому впечатлению, её основа связана не с горем, а с личным именем.

В основе фамилии лежит крестильное имя Гурий (в русском просторечии — Гур, Гуря). В некоторых говорах имя Гурий произносили как «Горей» — с «оканьем» или под влиянием других диалектных особенностей. От формы Горей через суффикс -ан- образовалось прозвище Горефан: так могли назвать человека, которого в быту звали Горей, а потом переделали в более развёрнутое «Горефанович» или просто «Горефан». Суффикс -ан- в русских фамилиях часто указывает на принадлежность или выделяет лицо по отношению к старшему в роду (сравните: Иван — Иванов, но Иван — Ивана — Иваныч; здесь — Горей — Горефан — Горефанов).

Менее вероятна, но не исключена версия от прозвища, данного человеку с трудной судьбой («горе фана» — «горе фаната»? — звучит натянуто). В ономастике нет подтверждений, что в основе лежит слово «горе» в прямом значении: фамилия образована по стандартной модели от имени, а не от нарицательного существительного с отрицательной окраской.

Фамилия встречается в центральных областях России, особенно в старообрядческой среде, где имя Гурий было популярно. В современных справочниках Горефановы отмечены в Тверской, Ярославской и Костромской областях. Это даёт основание считать фамилию северо-восточной по происхождению, с характерным для тех мест суффиксом -ан-.

Однокоренные фамилии — Гуреев, Гурьев, Гореев — более распространены, но именно Горефанов сохранил архаичную диалектную форму имени, что делает его особенно интересным для историка языка.