Фамилия Горнатко — редкий пример, где суффикс сразу выдаёт географию происхождения. Формант -ко типичен для украинской и белорусской ономастики, особенно в западных и центральных областях. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, эта модель чаще фиксировала прозвище или профессию отца, а не его имя.

Основа Горнат- почти наверняка восходит к слову «горн» — кузнечный очаг для нагрева металла. В диалектах «горнатый» или «горнат» могли называть подмастерье кузнеца, рабочего у горна. В белорусском языке есть слово «гарнат» (горшок, глиняный сосуд), но для фамилии кузнечная версия убедительнее: прозвища от орудий труда и производственных процессов давали чаще, чем от названий посуды.

Менее вероятная, но возможная версия — от личного имени Горна (редкая форма от Гордей или Гавриил) с суффиксом -атко. Такая модель встречается в западноукраинских говорах: Горнатко — «сын или потомок Горны». Однако фамилия не фиксируется в массовых списках, где основа была бы антропонимической, а не апеллятивной.

Сословная принадлежность носителей Горнатко — почти всегда крестьяне или мещане. В ревизских сказках XIX века эта фамилия встречается в Волынской и Гродненской губерниях, изредка — на Подолье. Дворянских родов с такой фамилией нет.

Если искать однокоренные параллели, стоит вспомнить фамилии Горнаков, Горнаев (русские, с тем же корнем «горн») и украинские Горначук, Горнаренко. Все они указывают на одну среду — ремесленников, работавших с огнём и металлом. Горнатко стоит в этом ряду как самая редкая форма, сохранившая диалектное окончание.