Фамилия Горшунина образована по классической русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — сын или дочь Горшуни. Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Горшуня. В русских говорах «горшун» — тот, кто делает горшки, гончар. Но это не единственная версия.

Горшуней могли прозвать человека с круглым, пузатым лицом или фигурой — по ассоциации с горшком. В северных и сибирских говорах слово «горшун» иногда означало «ворчун» или «брюзга», то есть прозвище могло отражать характер. Есть и более неожиданный поворот: в некоторых диалектах «горшуня» — это вид небольшой птицы, например, коростеля или дергача, так что прозвище могло достаться человеку с характерным голосом или походкой.

Суффикс -ин в фамилиях обычно указывает на краткую форму притяжательного прилагательного: Горшунин сын. В женском варианте — Горшунина — сохранилась та же основа, но с окончанием, указывающим на принадлежность к роду. Фамилия недворянская, скорее всего крестьянская или мещанская — такие фамилии на -ин массово закреплялись за простыми людьми после отмены крепостного права в 1861 году, когда потребовалось учесть всё население.

Географически фамилия Горшунина встречается в центральных областях России, особенно в бывших губерниях с развитым гончарным промыслом — Рязанской, Тульской, Калужской. Но основа «горш-» настолько распространена, что привязка к конкретному региону условна: гончары были везде, а прозвища по форме и характеру — тем более.

Сравнение с однокоренными фамилиями: Горшков, Горшечников. Если Горшков — прямая отсылка к гончару, то Горшунина стоит чуть в стороне, с уменьшительно-пренебрежительным оттенком. Это не мастер, а скорее человек, получивший прозвище в быту, возможно, за сходство с горшком или за привычку ворчать. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» такая модель описана как типичная для прозвищ, образованных от названий предметов с уменьшительными суффиксами.

Так что предки современных Горшуниных — скорее всего, не столько гончары по ремеслу, сколько люди, которых в деревне прозвали за внешность, характер или случайное сходство. Фамилия редкая, но прозрачная по смыслу — и в этом её ценность для того, кто ищет свои корни.