Фамилия Говнешкин — один из тех случаев, когда прямое значение основы режет глаз, но на деле всё сложнее и прозаичнее. В русской ономастике фамилии с корнем «говн-» встречаются, и их носители обычно не имели отношения к нечистотам в бытовом смысле. Словообразование здесь ключевое: суффикс -ешк- (в варианте -ешкин) указывает на прозвище, образованное с уменьшительно-уничижительным оттенком. То есть Говнешко — это не «тот, кто производит навоз», а скорее человек, которого так дразнили за какую-то неопрятность, неловкость или мелкую пакость.

Модель фамилии классическая: прозвище на -ко (Говнешко) плюс притяжательный суффикс -ин. Такие фамилии типичны для северных и центральных областей России, где формы на -ко были распространены. В отличие от южнорусских фамилий на -енко, здесь суффикс -ешк- встречается реже и обычно придаёт слову пренебрежительный оттенок: ср. «дурачок» — «дурашка», «говно» — «говнешко». Прозвище могли дать не за запах, а за характер: например, склочному или мелочному человеку.

Есть и другая версия, менее очевидная: в некоторых говорах «говно» означало не только экскременты, но и грязь, болотную жижу, тину. Тогда Говнешко — человек, живший у болота или работавший с грязью (торфяник, землекоп). Эта версия правдоподобнее, потому что объясняет фамилию без грубой брани: предок мог быть просто болотным жителем, а прозвище закрепилось за ним и потомками.

В дореволюционных переписях фамилия Говнешкин не фиксируется как дворянская или купеческая — это крестьянская или мещанская фамилия. Встречается она редко, преимущественно в Тверской, Ярославской и Костромской губерниях. После революции, когда многие меняли «неблагозвучные» фамилии, часть Говнешкиных могла стать Говоровыми, Гореловыми или просто сменить документы, поэтому сегодня носителей осталось мало.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Говнов, Говняев, Говендяев) показывает, что все они образованы от прозвищ, а не от прямого ругательства. В словаре Б. Унбегауна такие фамилии отнесены к «защитным» или «ироническим»: предкам давали прозвища, которые должны были отвести сглаз или подчеркнуть необычную черту. Так что Говнешкин — не свидетельство грязного прошлого рода, а след живой народной традиции называть людей метко и без прикрас.