Фамилия Гойна — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. Её основа, Гойн-, не имеет очевидных параллелей в русском именослове, что сразу отводит нас от самой частой модели «от крестильного имени». Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища, и ключ к её разгадке лежит в диалектной или иноязычной лексике.

Наиболее правдоподобная версия связывает фамилию с белорусским или украинским словом «гойна» или «гойний», которое означает «обильный», «щедрый», «достаточный». В этом случае прозвище Гойна мог получить зажиточный, хлебосольный человек или, наоборот, тот, кто любил пожить на широкую ногу. Подтверждением служит географическая привязка: фамилия встречается в основном на западе России, в Беларуси и на Украине — именно в зоне распространения западнорусских и украинских говоров.

Менее вероятная, но тоже возможная версия — происхождение от древнееврейского имени Гой (в значении «народ», «племя»), которое в форме Гойна могло стать прозвищем в еврейской среде. Однако для фамилии, бытующей у славян, эта гипотеза слабая: суффикс -а в такой модели нехарактерен, а само слово «гой» в славянских языках имеет устойчивое отрицательное значение («нехристь»), из которого вряд ли образовали бы нейтральное прозвище.

Словообразовательно фамилия Гойна стоит особняком. Она не имеет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский). Это так называемая «чистая» фамилия, где окончание -а выполняет роль родового показателя (жена Гойна → Гойна). Такая модель чаще встречается на западе славянского мира (у поляков, белорусов, украинцев) и нередко указывает на прозвищное, а не патронимическое происхождение. Если бы фамилия была образована от имени, мы бы скорее увидели Гойнов или Гойнин.

В истории фамилия не засветилась громкими именами — это типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия. Носители фамилии Гойна, вероятно, были людьми практичными и заметными в своей общине: либо теми, кого называли «гойными» за достаток и щедрость, либо, напротив, теми, кто получил прозвище с оттенком иронии. Сегодня фамилия остаётся редкой, и её обладатели — это, скорее всего, потомки выходцев из западных губерний Российской империи.