Фамилия Гранатская — редкий случай, когда её происхождение почти не вызывает споров у этимологов. Она принадлежит к группе фамилий, образованных от географических названий с помощью суффикса -ский/-цкий. Такая модель в XVI–XIX веках была типична для польской шляхты, украинской старшины, русского духовенства и дворянства, получивших фамилии по названиям имений или мест службы.

Основа фамилии — топоним Гранаты или Гранатово. Такие названия встречаются в Восточной Европе, например, деревня Гранаты в бывшей Гродненской губернии или село Гранатово на Волыни. Первый носитель фамилии, скорее всего, был владельцем или уроженцем такого места. Связь с плодом граната — вторична: в эпоху классицизма семинаристам иногда давали «растительные» фамилии вроде Гранатов или Виноградов, но форма Гранатская с окончанием -ская указывает именно на территориальную принадлежность.

Суффикс -ск- в фамилии говорит о том, что её носители принадлежали к привилегированным сословиям. В крестьянской среде такие фамилии были редкостью: крепостных чаще записывали с суффиксами -ов/-ев или -ин. Поэтому предки современных Гранатских могли быть либо мелкими помещиками, либо священниками, либо чиновниками, получившими фамилию по месту службы или рождения.

Само слово «гранат» в названии поселения могло иметь не фруктовое, а минералогическое значение — в некоторых регионах так называли места добычи гранатового камня. Впрочем, это лишь гипотеза: документальных подтверждений такой версии для конкретных сёл пока нет.

Фамилия остаётся малочисленной. В современных базах данных она встречается в основном в центральных областях России и в Беларуси, что косвенно подтверждает её западнорусские корни. Варианты написания — Гранадская или Гранацкая — возможны, но редки и обычно являются результатом ошибок в документах.