Фамилия Гриценгер — редкий для России пример фамилии немецкого происхождения, адаптированной к русской письменной традиции. В основе лежит немецкая фамилия Gritzenher, Gritzenhagen или Gritzenbach, где первая часть восходит к личному имени Gri(e)tz — краткой форме от Gregorij (Григорий). Вторая часть — германский топонимический суффикс -er, указывающий на выходца из определённой местности, либо -her (от Herd — очаг, дом) или -bach (ручей). Таким образом, Гриценгер мог означать «человек из поместья Гритцен» или «Григориев сын из такой-то местности».

На русской почве фамилия оформилась с типичным для заимствованных немецких фамилий окончанием -ер, которое не склоняется по русским падежам. Варианты написания — Гриценгер, Гриценгерр, реже Гриценгерн — встречаются в метрических книгах лютеранских приходов Поволжья и Санкт-Петербургской губернии, куда в XVIII–XIX веках приглашали немецких колонистов. В отличие от славянских фамилий на -ов/-ев, эта фамилия не несёт указания на отчество или занятие, а фиксирует географическое происхождение.

Спорных версий немного: иногда корень связывают с идишским גריטץ (gritts — «гречневая крупа»), но для немецкой ономастики это неправдоподобно — идишские фамилии с таким корнем обычно имеют суффиксы -ман или -берг, а не -гер. В словаре немецких фамилий (например, у Бахa или Готтшальда) модель Gritzen + -er встречается в записях XV–XVI веков в Баварии и Саксонии.

Социальный контекст: носители фамилии в России — потомки колонистов, ремесленников или лютеранских пасторов. В советское время фамилия не русифицировалась, сохранив исходную форму.