Фамилия Гроховатский — редкий пример, где географическая основа спорит со звуковой. Внешне она напоминает множество фамилий на -ский, образованных от названий населённых пунктов, и это, скорее всего, верный путь. Вероятнее всего, её корень — в топониме Гроховатое или Гроховатка. Такие названия могли получить сёла, расположенные на каменистой, «грохочущей» почве, где под ногами перекатывалась галька, или у реки с порогами. В украинской и южнорусской топонимике подобные имена встречаются: например, село Гроховатка есть в Винницкой области. Житель такого места получал прозвище Гроховатый, а его потомок, переезжая, становился Гроховатским — «выходец из Гроховатого».

Суффикс -ск- в этой фамилии не просто указывает на принадлежность, а подчёркивает дворянский или шляхетский способ образования фамилий в XVIII–XIX веках. Однако носителем мог стать и крестьянин, которого так записали при переписи по месту выхода. Вторая версия, менее правдоподобная, связывает фамилию с прозвищем Грохот — громогласный, шумный человек, но тогда ожидалась бы форма Грохотов или Грохотский, а не Гроховатский. Суффикс -оват- скорее указывает на признак местности: «гроховатый» — то есть каменистый, неровный, издающий грохот при ходьбе.

Интересная деталь: фамилия явно украинского или белорусского происхождения по модели. В русских говорах такое словообразование с -оват- для топонимов встречается реже, чем в западнорусских землях. Сравните с однокоренными Грохольский, Гроховский — они тоже ведут к названиям сёл, но уже в Польше и на Волыни. Гроховатский же остаётся более локальной, восточнославянской формой, не получившей широкого распространения. Встретить её можно в южных областях России и на востоке Украины, что подтверждает связь с конкретным, ныне, возможно, исчезнувшим хутором или деревней.

По сословному составу носители этой фамилии не образовывали единой группы: среди Гроховатских могли быть и казаки, и крестьяне, и мелкопоместные дворяне. Сведений о массовом присутствии в родословных книгах нет, что говорит о её преимущественно крестьянском или мещанском бытовании.