Фамилия Губарець звучит характерно для украинской ономастики. Её сразу выдаёт суффикс -ець, который в украинском языке выполняет ту же роль, что и русский суффикс -ец: он указывает на принадлежность человека к чему-либо по месту, занятию или свойству. Если бы фамилия была русской, она скорее всего звучала бы как Губарев. Форма на -ець — верный признак того, что перед нами выходец с территории современной Украины или юга России, где украинские говоры были распространены исторически.

Основа фамилии — Губарь. Это древнее прозвище, которое в разных регионах имело два основных значения. Первое — «голубь» (от диалектного «губарь» или «губа»). Прозвище могли дать человеку за мягкий, кроткий нрав, за воркование в разговоре или за внешнее сходство с птицей. Второе, не менее распространённое значение — «губастый», то есть человек с большими или толстыми губами. Прозвища по внешним приметам — один из самых древних и естественных способов именования.

Вероятно, предок носителя фамилии Губарець был просто человеком по прозвищу Губарь, а фамилию образовали по стандартной восточнославянской модели: «чей сын?» — «Губарев сын», что в украинском звучании закрепилось как Губарець. Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «губить» (в значении «портить, уничтожать»), но тогда прозвище звучало бы как Губитель, а не Губарь. Поэтому версия с голубем или губами остаётся основной.

Географически фамилия больше всего встречается в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев на Кубани и в Поволжье. Сословного барьера у фамилии нет: Губарями могли называть и крестьянина, и казака, и мещанина — прозвище не указывает на знатное происхождение, а лишь на меткую народную характеристику человека.