Фамилия Губарьков образована от прозвища Губарек. Чаще всего так называли человека с полными или припухлыми губами, но могло быть и переносное значение — обидчивый, тот, кто «дул губы». В основе лежит древнерусское слово «губа», которое в диалектах имело и другие оттенки: например, в новгородских говорах так называли гриб, а в южных — часть лица. Впрочем, для фамилии Губарьков первая версия — самая прямая и правдоподобная.

Словообразовательная модель здесь редкая и показательная. Суффикс -ек в прозвище Губарек — уменьшительно-ласкательный, но в фамилиях он встречается нечасто. Обычно русские фамилии на -ов/-ев образуют от полных прозвищ: Губарь → Губарев. А вот Губарьков — это уже вторая ступень: сначала прозвище Губарек (то есть «маленький Губарь» или «сын Губаря»), а потом от него — фамилия. Такая цепочка встречается в северных и центральных регионах России, где любили «двойные» уменьшительные формы.

По географии фамилия Губарьков не слишком широкая, но устойчивая. Чаще всего она встречается в Ростовской области, на юге России, а также в Поволжье — в Самарской и Саратовской областях. Встречаются носители и на Украине, что объясняется общими корнями прозвищной традиции.

Стоит отличать Губарькова от похожих фамилий: Губарев, Губанов, Губин. Все они восходят к одному корню «губа», но суффиксы разные. Губарев — от прозвища Губарь (толстогубый или мастер по губам, например, музыкант, играющий на губном инструменте). Губанов — от «губан» (губастый человек). Губин — от «губа» напрямую, без посредников. Губарьков же стоит особняком из-за того редкого суффикса -ек, который в XIX веке почти вышел из употребления в прозвищах, но успел закрепиться в фамилиях.

Таким образом, предок носителя фамилии Губарьков — человек, которого в быту ласково или насмешливо называли Губарек. Возможно, он был невысоким, с заметными губами, или же отличался обидчивым нравом. Фамилия закрепилась в южнорусских и поволжских землях, где уменьшительные формы прозвищ давали начало фамилиям второго порядка.