Фамилия Губарьковы (в мужском роде — Губарьков) ведет начало от прозвища Губарек. В основе лежит слово «губа», которое в народной речи имело два хода: так могли прозвать и человека с толстыми, выдающимися губами, и обидчивого, который любил «дуть губы». Прозвище Губарек — это уменьшительная форма: суффикс -ек указывал на молодого человека или на сына того, кого звали просто Губарь (а Губарь, в свою очередь, — более крупная производная от «губа»). Таким образом, Губарьков — это буквально «сын Губарька».

Сама фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Губарьк- добавили фамильный суффикс -ов, который закрепился за потомками. Такая схема типична для центральных и южных регионов России, где преобладали фамилии на -ов и -ев. В говорах Севера и Поморья чаще встречались бы формы Губарьких или Губарьковский, но здесь мы видим именно классический «овский» вариант.

Точную дату и место возникновения фамилии Губарьковы установить сложно: фамилии у крестьян и мещан оформлялись вплоть до XIX века, и письменные источники разрозненны. Однако прозвищный ряд с корнем «губ-» широко распространен в славянской ономастике: известны фамилии Губарев, Губин, Губкин, Губанов. Губарьков среди них выделяется редким суффиксом -ек, который придает прозвищу ласкательный или уменьшительный оттенок — возможно, так звали младшего в семье или подростка.

Сегодня фамилия Губарьковы встречается нечасто, но сохраняет живую связь с народным словотворчеством. Она не связана с каким-то одним сословием или ремеслом — это чисто прозвищное имя, которое закрепилось за родом по внешнему признаку или черте характера предка.