Фамилия Губерная — редкий случай, когда за основу взято не имя, не ремесло и не черта характера, а административная единица. Прямое значение — «относящаяся к губернии», «губернская». Скорее всего, так в быту называли жену или дочь губернатора, но не стоит спешить с выводами о высоком происхождении предков.

Разберём словообразовательную модель. Перед нами форма женского рода прилагательного, перешедшая в фамилию. В русской традиции фамилии на -ой/-ая (Губерная, Стрелецкая, Земская) обычно указывали на принадлежность к месту, сословию или должности. В данном случае основа «губерн-» восходит к латинскому «gubernator» (кормчий, правитель), которое через польское посредство попало в русский язык во времена петровских реформ. Первая губерния появилась в 1708 году, так что фамилия не могла возникнуть раньше этого времени.

Вероятнее всего, прозвище «Губерной» (или «Губерный») давали человеку, который служил в губернском правлении, канцелярии или имел отношение к губернскому городу. Например, приказчика, рассыльного, чиновника среднего звена. В крестьянской среде так могли прозвать мужика, который часто ездил в губернский город по делам. Фамилия в форме «Губерная» закрепилась за женщиной — вдовой или дочерью такого человека, либо за целой семьёй, где главой была женщина (что встречалось, но реже).

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и малороссийским областям, где окончание -ая в фамилиях встречается чаще, чем на севере. Встречаются варианты «Губерной» (с ударением на последний слог) и «Губернов», но форма «Губерная» сохранилась как архаичная, без перехода в притяжательный суффикс -ов.

Спорных версий здесь немного. Иногда фамилию пытаются связать с немецким «gubern» (править) или польским «gubernia», но это одно и то же. Важно не путать с фамилией «Губерман» — это совсем другая, еврейская, история. Прямой связи с губернаторским родом у Губерных, скорее всего, нет: чиновники высокого ранга обычно не получали прозвищ по должности, а их потомки носили более «благородные» фамилии на -ский. Так что предок носителя фамилии Губерная — человек из служилых людей, приказных или мещан, чья жизнь была связана с губернским аппаратом.