Фамилия Губейдулова — женская форма фамилии Губейдулов, которая почти со стопроцентной вероятностью восходит к мусульманскому арабскому имени Убайдулла (варианты: Убайдуллах, Обейдулла). В тюркской и татарской среде имя прижилось в произносительной форме «Губейдулла»: начальный звук «г» возник под влиянием местных диалектов, а «у» в первом слоге — результат адаптации арабского «у». Имя Убайдулла переводится как «маленький раб Аллаха» или «слуга Всевышнего», причём уменьшительная форма «Убайд» подчёркивает смирение и преданность, а не буквальный размер.

Модель образования типична для фамилий тюркских народов России: к имени Губейдулла добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова). Такие фамилии массово закреплялись за татарами, башкирами и другими мусульманскими народами Поволжья и Приуралья в XIX — начале XX века, когда при переписях и в документах требовалось дать «уличную» фамилию по отцу. То есть предок носителя фамилии с большой вероятностью носил имя Губейдулла, а его дети стали Губейдуловыми.

В отличие от чисто славянских фамилий, где суффикс -ов указывает на принадлежность («чей сын?»), здесь он просто русифицирует исходное имя, не меняя его смысла. Стоит отметить, что фамилия нередко встречается в написании с буквой «о» в конце (Губейдулов), а не «а», но в русской традиции женский вариант всегда заканчивается на -а. Встречаются и варианты с мягким знаком (Губейдульев), но они гораздо реже и возникали из-за ошибок писарей, не знавших арабского корня.

Географически фамилия распространена преимущественно в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарских диаспор в других регионах России и странах СНГ. Сословно предки Губейдуловых могли быть как крестьянами, так и муллами или торговцами — имя Убайдулла не было привилегией знати, его давали и простым верующим. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках фамилия фиксируется с конца XIX века, хотя само имя известно с первых веков ислама.

Единственный нюанс: если фамилия происходит не от арабского имени, а от прозвища или названия местности (например, от тюркского «гюбей» — «горб» или «выступ»), то это маловероятно, так как продуктивность таких основ в фамилиях Поволжья значительно ниже, чем антропонимических. Поэтому версия с именем — основная и наиболее обоснованная.