Фамилия Гудилин — из числа тех, что ставят перед исследователем несколько разных версий, и каждая по-своему убедительна. В основе фамилии лежит прозвище Гудило, а суффикс -ин указывает на принадлежность: буквально «сын Гудилы». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от основ на -а, -я.

Сам глагол «гудить» многозначен, и от того, какое значение имел в виду тот, кто дал прозвище, зависит, кем был первый носитель фамилии. В южных и западных диалектах «гудить» означало «порицать, корить, хаять, осуждать». Если так, то Гудилой прозвали человека бранчливого, склонного всех ругать. В новгородских говорах тот же глагол имел противоположный оттенок — «манить, обольщать, обманывать». Здесь Гудило — это уже плут, мошенник, ловкий обманщик.

Есть и третья, не менее вероятная версия: «гудить» связано с гудком — старинным русским смычковым инструментом. В этом случае Гудило — музыкант, гудошник. В древнерусской культуре гудцы (игрецы на гудке) были заметными фигурами на праздниках и пирах, так что прозвище могло быть профессиональным. Какая из версий верна для конкретной семьи — без genealogических изысканий не скажешь, но все три имеют под собой реальную языковую почву.

Словообразовательная модель проста: корень гуд-, суффикс -ил- (как в «светило», «громила») образовывал прозвище деятеля, а затем фамильный суффикс -ин привязал его к роду. Фамилия Гудилин встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, что косвенно подтверждает связь с южными диалектами, хотя носители есть и в других областях. В отличие от фамилий на -ов (Гудов, Гудков), форма на -ин характерна для прозвищ, оканчивающихся на гласный, и это делает её более «личной», подчёркивающей индивидуальную черту предка.