Фамилия Гудована — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее этимологии. Скорее всего, перед нами украинская или южнорусская фамилия, образованная от прозвища Гудован. Основа — глагол «гудеть» или родственное «гуда» (шум, гул, гудение). В говорах так могли назвать человека с низким громким голосом, любителя громко петь или просто шумного, неспокойного человека. Суффикс -ан- в украинской антропонимии типичен для прозвищных фамилий: он придаёт экспрессивность (ср. Гулян, Скакан, Лепетан).

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «гудова́ть» — в некоторых западнорусских и украинских говорах так говорили о долгой, тягучей работе или о том, кто тянет время, медлит. В этом случае прозвище могло получить неторопливый, основательный человек. Ещё одна гипотеза — от имени Гуд, сокращённой формы от Гудим или Гудослав (редкое славянское имя с корнем «гуд» — музыкальный инструмент), но для фамилии Гудована это маловероятно: суффикс -ована нехарактерен для патронимических форм от крестильных имён.

Формально фамилия выглядит как притяжательное прилагательное с суффиксом -ов- и окончанием -а (женский род), но в русской традиции фамилии на -ана в такой форме почти не встречаются. В украинском языке фамилии на -а могут быть как мужскими, так и женскими (например, Гудована — мужская, склоняемая). Встречаются также параллельные варианты: Гудованов (русифицированная форма с двойным суффиксом) и Гудован (без суффикса). Поиск по базам показывает, что носители фамилии Гудована сосредоточены в основном в Запорожской, Днепропетровской и Харьковской областях Украины, что подтверждает её украинское происхождение.

Социальный состав предков, вероятно, был крестьянским или казачьим: прозвища на -ан редко встречались в дворянской среде. Фамилия не фиксируется в дореволюционных родословных книгах, что косвенно указывает на позднее оформление — в XIX веке, когда прозвища стали закрепляться как фамилии у непривилегированных сословий.