Фамилия Гудовский образована по типичной для восточнославянских фамилий модели с суффиксом -ский, который указывает на принадлежность к местности или роду. В основе лежит прозвище Гуд, и здесь открывается поле для двух основных версий, обе из которых имеют диалектную поддержку.

Первая версия отталкивается от корня «гуд» в значении «гудение, шум», который в южных и западных говорах перешёл в смысл «порицать, корить, хаять, осуждать». В новгородских диалектах тот же корень означал «манить, обольщать, обманывать». Соответственно, прозвищем Гуд могли наградить либо сквернослова и любителя пересудов, либо, наоборот, плута и ловкого обманщика — человека, который «нагудит» и обведёт вокруг пальца.

Вторая версия связывает прозвище с народным музыкальным инструментом — гудком, предком современной скрипки. Гудок был распространён в среде скоморохов и народных музыкантов, так что Гудом вполне могли называть человека, который играл на гудке или даже изготавливал такие инструменты. Эта версия кажется не менее правдоподобной, поскольку прозвища по роду занятий — один из самых частых источников русских фамилий.

Фамилия Гудовский, скорее всего, имеет польское или украинское происхождение: суффикс -ский типичен для шляхетских фамилий Речи Посполитой, но мог закрепиться и у крестьян или мещан, переселившихся из этих земель в центральную Россию. Встречается она в разных регионах, но чаще — на западе и юге бывшей Российской империи. Однокоренные фамилии — Гудов, Гудков, Гуд — различаются только суффиксальной моделью, но восходят к тому же корню и тем же возможным значениям.