Фамилия Гудовичев — редкий случай, когда прозвище образовано от глагольной формы, а не от существительного. В её основе лежит повелительное наклонение «гуди» от глагола «гудеть» или «гудить» (в некоторых говорах — «гудовить», то есть играть на гудке, гудеть). Суффикс «-ич» указывает на отчество или потомка по мужской линии, а конечное «-ев» — типичный русский фамильный суффикс принадлежности. Получается, Гудовичев — это «внук (или сын) того, кого прозвали Гудь, Гудя» или, точнее, «потомок человека по прозвищу Гудович».

Само прозвище Гудович могло означать «сын Гуды», но в русской ономастике такие формы часто закреплялись как самостоятельные именования. В основе — «гуда»: в древнерусском языке так называли музыканта, играющего на гудке (старинном струнном инструменте), или просто человека, который издаёт гул. В некоторых диалектах «гудовить» означало «шуметь, гудеть», поэтому прозвище могли дать громкому, шумному человеку или тому, кто постоянно напевал себе под нос.

Версия о связи с тюркским «гуд» (как в фамилии Гудов) менее вероятна: суффикс «-ичев» нехарактерен для тюркских заимствований и указывает на славянскую модель патронимии. Фамилия встречается крайне редко, преимущественно в центральных и северо-западных областях России, где были распространены гудочники — бродячие музыканты, игравшие на гудке. Скорее всего, первый носитель фамилии был либо таким музыкантом, либо получил прозвище за манеру говорить или петь.

Написание через «о» (Гудовичев, а не Гудовичов) фиксирует историческое ударение на втором слоге и соответствует правилам русской орфографии XIX века, когда после шипящих и «ц» под ударением писали «о», а в безударной позиции — «е». В данном случае суффикс «-ев» безударный, поэтому закрепилось написание с «е».