Фамилия Гугуев — одна из тех, что произошла напрямую от прозвища, а не от имени или профессии. В её основе лежит слово «Гугуй», а оно, в свою очередь, связано с глаголом «гугукать». В русских говорах «гугукать» означало подавать весёлый, довольный голос — нечто среднее между воркованием и радостным возгласом. Чаще всего так называли младенцев: если ребёнок родился здоровым, крепким и звонко «гугукал», его могли ласково прозвать Гугуем. Позже это прозвище закреплялось за взрослым человеком, если он сохранял жизнерадостный, задорный нрав.

Словообразовательная модель здесь классическая для русского бытового ономастикона: прозвище на -ей (-ай) плюс типичный патронимический суффикс -ев. Форма «Гугуев» означает «сын Гугуя» или «потомок того, кого звали Гугуй». Интересно, что фамилия эта довольно редкая, и её ареал тяготеет к южнорусским и донским говорам, где глагол «гугукать» был в ходу до недавнего времени.

Не стоит путать эту фамилию с тюркскими или кавказскими корнями, хотя внешне она на них похожа. В отличие, например, от фамилии Гугуа или Гугунашвили, русский Гугуев — это чисто звукоподражательное прозвище, без связи с этнонимами или географическими названиями. Если ваш предок носил фамилию Гугуев, скорее всего, он был человеком с юга России, и в его семье передавали память о бойком, голосистом пращуре.

Встречаются варианты написания с одной «г» (Гугуев) — это нормально для фамилий, образованных от прозвищ с удвоением, которое со временем могло упрощаться. Но исторически верной считается форма с двумя «г», так как она точнее передаёт звукоподражательную основу.