Фамилия Гулишов — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа, скорее всего, не связана с тюркским словом «гуль» (цветок), хотя такое предположение напрашивается. На самом деле, суффикс -шов указывает на иную модель образования. В русских фамилиях суффикс -ш- часто встречается в прозвищах, образованных от глаголов: например, Гуляшов могло произойти от «гулять» (гуляка, гулевой человек). Но в случае с Гулишовым корень короче — «гул».

Вероятнее всего, фамилия восходит к прозвищу Гулиш, которое дали человеку с громким голосом или шумному, крикливому. В русских говорах слово «гул» означало шум, гул, отзвук, а «гулить» — издавать гул, громко говорить. Форма Гулиш — это прозвище с уменьшительным или уничижительным оттенком (суффикс -иш, как в «домишко»), то есть «небольшой, но шумный человек». Фамилии на -шов характерны для южнорусских и украинских земель, где часто встречается такая словообразовательная модель (ср. Гуляшов, Гречишов).

Вторая, менее вероятная версия — что основа «Гул» восходит к имени Гулий, которое могло быть краткой формой от канонического имени Гурий (древнееврейское «львёнок»). В этом случае Гулиш — производная форма того же имени, а фамилия — патроним (сын Гулиша). Но эта версия слабее, так как имя Гурий давало фамилии Гурьев, Гуреев, а не Гулишов.

Географически фамилия встречается в основном на юге России и в Поволжье, что подтверждает её связь с русскими диалектными прозвищами. Никакого отношения к тюркским или кавказским корням она, скорее всего, не имеет — это чисто русская фамилия, образованная от характеристики поведения. Предок Гулишовых, судя по всему, был человеком с громким голосом или обладал шумным нравом, за что и получил своё прозвище.