Фамилия Гунуева — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. Носители этой фамилии сосредоточены на Северном Кавказе, прежде всего в Чечне и Ингушетии. Это сразу подсказывает, что разбирать её нужно не через привычные русские суффиксы -ов/-ев, а через национальную модель образования.

Основа фамилии — «Гуну» (или «Гуной»). В чеченском языке это название одного из крупнейших исторических тайпов (родовых объединений) — Гуной. Тайп Гуной традиционно связывают с плоскостными районами Чечни, и его представители сыграли заметную роль в истории региона. Фамилия Гунуева, таким образом, — это русифицированная форма родового имени: к основе «Гуну» добавили русский суффикс -ев, который в данном случае не несёт значения «чей?», а просто оформляет фамилию по привычному для документов образцу. В самой Чечне фамилия чаще звучит как Гуноев или Гунойский, но при записи в российских метриках и паспортах закрепился именно вариант Гунуева.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским корнем «гун» (солнце) или с монгольским «гун» (глубина, глубокий). Однако для фамилии, чьи носители почти поголовно вайнахи, притягивать степные кочевые корни без документальных подтверждений было бы натяжкой. Если у предка и было прозвище Гуну (в переводе с чеченского — «кузнец» или «мастер по металлу», хотя это значение спорно), то оно всё равно указывало бы на его принадлежность к той же родовой группе, а не на личное ремесло.

Итак, человек с фамилией Гунуева в подавляющем большинстве случаев — потомок представителя тайпа Гуной, одного из старейших чеченских родов. Это не фамилия-прозвище и не фамилия-профессия, а фамилия-родство, сохранившая связь с землёй и историей предков, живших на равнинах северо-восточного Кавказа.