Фамилия Гурджий — редкий случай, когда географическое происхождение прямо зашито в основе. Это не крестьянское прозвище по профессии или внешности, а указание на родину: носитель фамилии или его предок происходил из Грузии. В тюркских языках, особенно в османском и крымскотатарском, слово gürcü (или gürci) означает «грузин». В русском языке эта форма закрепилась в написании «гурджи» или «гурджий» — так называли выходцев с Кавказа в южных регионах, особенно в Крыму и на Кубани.

Суффикс -ий здесь не уменьшительный и не притяжательный (как в фамилиях на -ин или -ов). Он выполняет роль русифицирующего окончания, адаптируя тюркское слово к русской грамматической модели. Аналогично образованы фамилии Каджий, Аджий, Хаджий — все они происходят от тюркских или арабских основ, которые в русском языке получили окончание -ий для удобства склонения.

По модели образования фамилия Гурджий относится к так называемым «этническим» прозвищам. Такие фамилии давали не столько самому грузину, сколько человеку, который жил среди грузин, торговал с ними или имел с ними прочные связи. В Крымском ханстве и на юге Российской империи гурджиями называли не только этнических грузин, но и армян, греков или татар, долгое время живших в Грузии и перенявших её обычаи. Поэтому предок носителя фамилии мог быть и не грузином по крови, но его социальное или географическое происхождение было прочно связано с Грузией.

В написании фамилии встречается вариативность: Гурджи, Гурджиев, Гурджиян. Форма Гурджий — самая старая и прямая, она почти не изменилась с тех пор, как её записали в метрические книги. Распространена фамилия в основном на юге России, в Краснодарском крае, Ростовской области и в Крыму, а также среди потомков крымских татар, эмигрировавших в Турцию. Никакого отношения к слову «гурд» (в значении «волк» из тюркских языков) фамилия не имеет — это ложная этимология, которая возникает из-за созвучия.